この教派は、16世紀の宗教改革の時代に活躍したカルヴァン（中学校や高校の歴史教科書にも登場します）の神学に基づく、プロテスタント教会の一つです。

「聖書は誤りなき神の言葉であり、信仰と生活の基準である」と信じ、「聖書によって常に自己を改革し続ける教会」であることを目標としています。

日本キリスト改革派教会は、1946年に、日本基督教団から旧日本基督教会の十数名が分かれて創立されました。創立に加わった人々はいずれも、宗教改革の信仰に堅く立つ人々であり、特に改革者カルヴァンの信仰と神学に基づき、欧米で「改革派」あるいは「長老派」と呼ばれてきた教会の伝統に養われていました。

現在、教会数は約130、会員数は約9,000名を数え、全国を五つの地域中会に分けています。北海道・東北を圏内とする東北中会、関東を圏内とする東部中会、中部地方を圏内とする中部中会、関西・中国・九州・沖縄を圏内とする西部中会、そして四国を圏内とする四国中会です。

この教派の特徴は、ウエストミンスター信仰告白および大・小教理問答を信仰基準としていること、そして教会政治に長老制（長老主義）を採用していることにあります。信徒は「神の栄光を現し、永遠に神を喜ぶこと」を人生の主な目的とし、信仰のみならず、学問や日々の生活においても、旧約・新約聖書の教えを規範として歩むことを大切にしています。